События аниме Синдуальность: Нуар разворачиваются в разрушенном миру будущего, в годе 2242-м. Когда-то неизвестное явление под названием «Слёзы новолуния» обрушилось на планету токсичным дождём, погубив почти всё живое и породив опасных существ, охотящихся за выжившими. Люди вынуждены были прятаться глубоко под землёй, где возникли подземные города и цивилизация, выстроенная на песке выживания. В таком мире нашли применение кристаллы — новый источник энергии, изменивший экономику и технику. Чтобы добывать их, создали боевые машины-роботы, которыми управляет человек при поддержке андроида; пилоты получили название скитальцы, а самих андроидов окрестили магусами. Главный герой — юный Каната, обитающий в подземном городе Амасия, где мечтают о большем и готовятся к будущей роли скитальца. Он усердно тренируется и учится, неустанно приближаясь к своей цели. Однажды во время исследований подземных коридоров он находит загадочного андроида Нуар, утратившего память. Казалось бы, обычный магус, но вскоре Каната замечает в её искусственном разуме черты, выходящие за рамки стандартной программы: неожиданные решения, скрытые мотивации и уникальное восприятие мира, которое настойчиво бросает вызов ожиданиям.
