Благодаря инновациям профессора Юко Кодзуки и мистическим способностям Касуми Ясиро курсант Такэру Сироганэ оказывается в родном мире, не теряя ни минуты. Он рассчитывает на помощь Юко из этого измерения, чтобы довести до конца проект «Alternative IV» — последнюю надежду человечества в схватке с БЕТА, инопланетной расой, занявшей планету. Разработанный план близится к финалу, и Такэру вместе с другими курсантами заканчивает обучение в пилотной академии Йокогамы. Однако во время испытаний обновлённой операционной системы для тактических боевых истребителей — гигантских доспехов, которыми вооружено человечество в бою с врагами — БЕТА устраивают засаду на команду. Едва они избегают гибели, Такэру получает тяжелую травму и становится свидетелем жестокого исчезновения одного из близких друзей. Потеряв волю к борьбе, он возвращается в другой мир, где сталкивается с похожей утратой. По теории Юко, судьбы людей из параллельных вселенных предопределены одной и той же участью. Поэтому Такэру должен преодолеть травму, если хочет защитить тех, кто ему дорог.
