Сезон второй аниме «Пираты Чёрной лагуны» переносит зрителя в мрачный водоворот преступного мира Роанапура. Рокуро Окадзима, которого знают под именем Рок, когда-то был обычным офисным сотрудником, незаметным и застывшим в рутине. Но его похищает компания «Лагуна» — не только перевозчик грузов, но и прикрытие для одной из самых жестоких банд наёмников-пиратов в городе с дурной репутацией. Брошенный начальством, Рок вынужден принять их условия и попробовать выжить в условиях постоянной смены лидеров и выгод. Ему приходится держаться на плаву, лавируя среди преступников, одновременно избегая гнева Реви, прозванной Двурукой, чьё вооружение не знает равных. Во втором сезоне фокус смещается на противостояние японских кланов за власть в теневом мире, и на сцену выходит новая сила — могущественная московская группировка «Отель Москва», чьи амбиции радикально изменяют баланс сил.
