Обычный старшеклассник Аруто Кирихара увлечён рассказами об Алисе, сочинёнными таинственным отшельником из параллельного мира — Алтернайтом Л. Тахионом. Однажды ночью, когда он дописывает собственную версию предполагаемой «третьей книги», на него обрушивается образ: девушка, парящая под лунной пеленою, и она точно копия той Алисы, о которой он мечтал в своих фантазиях. Аруто выбегает из дома и устремляется за летающей фигурой по мокрому тротуару, пока не оказывается в библиотеке, став свидетелем её схватки с другой девушкой в костюме. Так начинается его внезапное знакомство с миром Алисы — элитным сообществом сильнейших подростковых девушек, которые регулярно выходят в Стране Чудес за пределы обычной реальности, чтобы украсть друг у друга «скрытые истории». Когда все истории будут набраны, они объединят их в легендарный третий том «Вечной Алисы», дарующий своему хозяину одно желание. Вероятнее всего, это не Аруто, который не способен превратиться в волшебную девушку. Но возможно это окажется его любящая младшая сестра, Кираха Кирихара, или же та девушка из его мечт — Арису Арисугава.
