После окончания третьей мировой войны на территории Токио образовалась обширная заражённая зона, которую назвали Чёрное Пятно. Её окружили стенами и поместили под жесткую изоляцию, но со временем на выжженной земле всё же стали появляться признаки жизни. Среди тех, кого забыли внутри, возникли загадочные люди с необычными силами: они умеют поджигать огонь, управлять ветром и даже влиять на гравитацию. Обычные горожане, испуганные такими возможностями, отвергли их и окрестили Изгоями. Действие разворачивается в 2130 году, примерно через полвека после той катастрофы. Фармацевтическая корпорация Симеон, достигшая огромного влияния, разместила свой главный офис прямо в сердце Чёрного Пятна. С одной стороны компания заявляет о благотворительности, с другой — проводит бесчеловечные эксперименты над людьми, создаёт и продаёт богатым лекарства против старения, а её сотрудники яростно охотятся на Изгоев, расправляясь с любым, кто осмеливается сопротивляться. Чтобы свергнуть власть Симеона, четыреста членов Сопротивления предпринимают попытку устранить главу корпорации — Адама Арклайта, но Изгои из Элитной Четвёрки расправляются с нападающими. Единственный выживший, Круз Шильд, чудом остаётся в живых и встречает двух могущественных Изгоев — Адама Блейда и Еву Нойшванштайн — которые вместе с их другом-профессором Гидо решают помочь Крузу свергнуть Симеона.
