Действие разворачивается в далеком будущем, когда передовые технологии стали частью повседневной жизни и даже карточные дуэли не обходятся без технических новшеств. Главный герой — Юма Цукумо — стремится подняться на вершины турнира «Дуэльных монстров», но пока он ещё новичок и не обретал устойчивой тактики или просчитанных стратегий. Во время одной из дуэлей он вызывает на поединок городского чемпиона Рёге Камисиро, надеясь проверить свои силы. Непредсказуемый поворот судьбы случается, когда рядом с Юмой появляется загадочный призрак без воспоминаний — Астрал. Он объясняет, что его память раздроблена на девяносто девять карточек, названных «Номеры». Теперь задача героя выходит за рамки обычных побед: ему предстоит не только пробиться к вершинам турнира, но и помочь призраку-дуэлянту вернуть утраченное прошлое. Их путь пройдёт по ярким городским кварталам и загадочным лабораториям, где каждая карта‑Номер может открыть новую страницу памяти и приблизить восстановление истории и взаимного доверия.
