После освобождения от прежних полномочий в 501-м секретном подразделении Мотоко Кусанаги оказывается вынужденной действовать по приказам Дайсука Арамаки. Неожиданный взлом системы искусственного интеллекта Логикомы вносит существенные перемены в ход событий и заставляет Бато задуматься о составе команды. Он удаётся заручиться поддержкой бывшего армейского разведчика Исикавы и специалиста по взрывчатке и подрывному делу Бомы, чьи навыки обещают усилить оперативную.changed линию расследования. Чтобы продвинуть дело вперёд, Кусанаги намерена привлечь к расследованию ещё и снайпера Саито, а также тайного агента Падзу, чьи данные могут открыть новые перспективы и подсказки. В это время Девятый отдел развертывает очередную операцию, и команда сталкивается с новыми задачами, требующими слаженной работы и слаженной координации между участниками.






