Юный Дзиро становится свидетелем страшного удара судьбы: в его доме погибают мама и сестра, и он оказывается обвинённым в преступлении, которого не совершал. Спасаясь от клейма, он уходит из родной деревни и встречает загадочного священника по имени Тэнкай, который принуждает его выполнить жестокий приказ — уничтожить отступника-ниндзя по прозвищу Тародза. Выполнив задание, Дзиро начинает путь подготовки к жизни мастера-убийцы, проходя через суровую школу и жесткие испытания. Спустя годы он узнаёт шокирующую правду о себе: он сирота, а его биологическим отцом был сам Тародза, когда-то служивший Тэнкаю, однако тот порвал с миссией и влюбился в женщину из народа айнов. Между тем сёгунат вынашивает идею найти утраченное сокровище, известное как Капитан Кидд, и использовать его для новой изоляции Японии от остального мира. Держась за скрытые подсказки, которых хранит Тародза, Дзиро вместе с юной ниндзя Оюки и рабом по имени Сэм отправляются в путешествие через Россию и Америку в поисках артефакта, надеясь с его помощью отомстить Тэнкаю и окончательно расправиться с прошлым.






