После очередного удара мир лишился своих Евангелионов, и Шинджи, Аска и Рей вынуждены укрыться в одном из немногих уцелевших очагов человечности на полуразрушенной планете. Здесь каждый из них строит своё существование заново, вдали от той роли, которую когда–то занимали как пилоты ЕВа. Одни пытаются забыть прошлое, другие ищут смысл в серых буднях, но воспоминания всё равно возвращаются и напоминают о том, чем они были. Небо над их головами продолжает гнуть новую угрозу: надвигается удар, который может стать окончательным концом эпохи Евангелиона и навсегда изменить судьбу мира. В то же время разворачивается амбициозный проект по совершенствованию человечества, и Wille вынуждена пройти через последний, выматывающий бой, чтобы остановить надвигающийся кошмар. Их путь полон испытаний и сомнений, но именно в этом испытании они должны найти ответ на вопрос: удастся ли сохранить будущее и предотвратить Последний удар.
