В глубокой темноте ночного города Рю Хаябуса оказывается между ударами наёмников и неожиданной охотой за своей жизнью. Прогонив преследователей, он понимает, что угроза — не просто личная, а связана с загадочной корпорацией Friedman Company, чьим руководителем является доктор Нед Фридман. Его недавнее заявление о найденном лекарстве от рака потрясло общество и привлекло внимание множества опасных сил. Чтобы разобраться в мотивах противников, Рю находит дом ученого и там сталкивается со своей подругой-журналисткой Сарой, которая также расследует дело таинственного доктора. В паре они начинают распутывать сеть интриг и вскрывают жестокие механизмы открытия Фридмана, понимая, насколько это переплетено с прошлым героя. Но радость сменяется тревогой: возлюбленная Рю Айрин Лью исчезает без следа. Теперь ему предстоит снова принять образ Ниндзя-Дракона — спасти её и столкнуться с новой, глобальной угрозой, нависающей над всем миром.
