История начинается на длинной прогулке Нацумэ вместе с его необычным компаньоном — духом по кличке Мадара, которого друзья зовут Нянко-сэнсэй. В дружной и слегка дерзкой перепалке Нацумэ подшучивает над ёкаем, намекая на его якобы пышные формы, и спор разгорается с новой силой. Но в самый разгар их словесной заварушки Мадара замечает стрекозу и стремительно бежит за ней, забывая обо всём на свете. Это внезапное увлечение приводит их в лес, где воздух кажется пропитаным шепотами духов и силой древних чар. В этом таинственном месте Мадара встречает парочку — девушку и мальчика, которым предназначено достать нечто важное и спрятанное глубоко среди деревьев. Так начинается новое приключение Нацумэ и Нянко-сэнсэя: им предстоит пройти через испытания леса, столкнуться с духами и загадками, а дружба и доверие станут ключами к разгадке таинственной задачи, которая может поменять их судьбы. Встреча с мистическим миром откроет им двери в давно забытые истории и покажет, насколько сильнее они вместе.
