В 2006 году вышел фильм-продолжение, действие которого разворачивается спустя два года после того, как Мотоко Кусанаги покинула подразделение 9. Руководство перешло к Тогуса, который расширил штат до двадцати оперативников, и обновлённая команда сталкивается с рядом странных дел, ведущих их к одному из самых влиятельных хакеров под прозвищем «Кукольник». В разгар расследования Бато неожиданно встречает Мотоко; она предупреждает держаться подальше от Solid State Society (общество стабильности государства). Бато ломает голову: может ли Мотоко оказаться тем самым Кукольником? С каждым новым делом отдел всё ближе подходит к разгадке. Но кто же скрывается под маской Кукольника? Как скажутся отношения между Бато и Мотоко? И какую правду прячут эти тщательно спланированные преступления?
